Анна Михайловна Короткова, младший научный сотрудник, ИЦиГ СО РАН
630090 Россия, Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева, 10
Anna M. Korotkova, Junior Researcher, ICG SB RAS
10, Academician Lavrentyev Avenue, Novosibirsk, 630090 Russia
Татьяна Владимировна Кукоева, старший лаборант, ИЦиГ СО РАН
630090 Россия, Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева, 10
Tat’yana V. Kukoeva, Senior Laboratory Assistant, ICG SB RAS
10, Academician Lavrentyev Avenue, Novosibirsk, 630090 Russia
Игорь Васильевич Тоцкий, кандидат биологических наук, научный сотрудник, ИЦиГ СО РАН
630090 Россия, Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева, 10
Igor V. Totsky, Cand. Sci (Biology), ICG SB RAS
10, Academician Lavrentyev Avenue, Novosibirsk, 630090 Russia
Юрий Николаевич Григорьев, старший научный сотрудник, Лаборатория селекции, семеноводства и технологии возделывания полевых культур, СибНИИРС — филиал ИЦиГ СО РАН
630501 Россия, Новосибирская область, р.п. Краснообск, ул. С-200, зд. 5/1
Yurij N. Grigoriev, Senior Researcher, ICG SB RAS, Siberian Research Institute of Plant Cultivation and Breeding – Branch of the ICG SB RAS
P.O. Box 375, Bldg. 5/1, S-200 Street, Krasnoobsk, Novosibirsk Region, 630501 Russia
Олеся Юрьевна Шоева, кандидат биологических наук, заведующая лабораторией, ИЦиГ СО РАН
630090 Россия, Новосибирск, пр. Академика Лаврентьева, 10
Olesya Yu. Shoeva, Cand. Sci. (Biology), Head of Laboratory, ICG SB RAS
10, Academician Lavrentyev Avenue, Novosibirsk, 630090 Russia
Актуальность. Голозерный ячмень является перспективной продовольственной культурой. Для увеличения его производства необходима активная селекционная работа по созданию высокопродуктивных сортов. Целью представленной работы является апробация STS-маркера к гену Nud1, контролирующему пленчатость, для отбора голозерных гибридов ячменя. Материалы и методы. Генотипирование 112 гибридов популяции F2, полученной с помощью скрещивания голозерного черноколосого сорта ‘Jet’ и пленчатого белоколосого сорта ‘Эльф’, проводили с помощью праймеров wF2 и kR1, либо tR2, в режиме обычной ПЦР, которая позволила амплифицировать фрагменты рецессивного, либо доминантного аллелей гена Nud1, соответственно, а также в режиме мультиплексной ПЦР, позволяющей одновременно амплифицировать фрагменты и доминантного, и рецессивного аллелей гена Nud1. Данные генотипирования сопоставляли с фенотипами гибридов. Результаты и обсуждение. Показана возможность использования мультиплексной ПЦР с набором праймеров wF2, kR1, tR2 для выявления доминантных и рецессивных аллелей гена Nud1 в гибридном материале. Однако, если наблюдаемая частота гибридов гомозиготных по рецессивному аллелю nud1 почти полностью соответствовала их ожидаемой частоте при моногенном типе наследования, то явное преобладание гомозигот по доминантному аллелю Nud1 и недостаток гетерозигот по сравнению с ожидаемыми частотами гибридов этих групп указывает на ошибочную идентификацию части гетерозигот как доминантных гомозигот, что нужно учитывать при отборе пленчатых форм с помощью генотипирования. Заключение. STS-маркер, амплифицируемый с помощью праймеров wF2, kR1, tR2, возможно использовать для отбора рецесcивных гомозигот nud1nud1 из гибридных популяций, однако для более надежной идентификации гетерозигот и гомозигот по доминантному аллелю гена Nud1 необходим дополнительный анализ.
Background. Naked barley is a promising food crop. To enhance its production, active breeding is required to create productive varieties. The purpose of this study was to test the STS-marker for the Nud1 gene controlling the hulled phenotype, and use it for the production of naked barley hybrids. Materials and methods. Genotyping of 112 F2 hybrids obtained by crossing the naked black variety ‘Jet’ and the hulled white variety ‘Elf’ was carried out using wF2 and kR1, or tR2 primers in the regular PCR mode to amplify the recessive or dominant alleles of the Nud1 gene, respectively, and also in the multiplex PCR mode, which allows simultaneous amplification of both dominant and recessive alleles of the Nud1 gene. The genotyping data were compared with those on phenotypes of hybrids. Results and discussion. The possibility of using multiplex PCR with a set of primers wF2, kR1, and tR2 for identifying dominant and recessive alleles of the Nud1 gene in hybrid material has been demonstrated. However, while the observed number of hybrids homozygous for the recessive allele nud1 almost completely corresponded to their expected number, the clear predominance of homozygotes for the dominant allele Nud1 and the lack of heterozygotes compared to the expected number of hybrids of these groups indicates erroneous identification of some heterozygotes as dominant homozygotes, which must be taken into account during selection of hulled barleys by genotyping. Conclusions. The STS-marker amplified by primers wF2, kR1, and tR2, can be used to select recessive homozygotes nud1nud1 from hybrid populations, however, additional analysis is required for a more reliable identification of heterozygotes and homozygotes for the dominant allele of the Nud1 gene.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.