bioselБиотехнология и селекция растенийPlant Biotechnology and Breeding2658-62662658-6258VIR10.30901/2658-6266-2024-3-o5biosel-248Research ArticleСОХРАНЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ РЕСУРСОВ РАСТЕНИЙ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БИОТЕХНОЛОГИЧЕСКИХ ПОДХОДОВCONSERVATION OF PLANT GENETIC RESOURCES USING BIOTECHNOLOGICAL APPROACHESНоменклатурные стандарты и микросателлитные профили сортов малины селекции Федерального научного центра им. И. В. МичуринаNomenclatural standards and microsatellite profiles of raspberry cultivars bred at the I.V. Michurin Federal Scientific Centerhttps://orcid.org/0000-0001-8103-2191КамневА. М.KamnevA. M.

Антон Михайлович Камнев, младший научный сотрудник, лаборатория молекулярной селекции и ДНК-паспортизации, отдел биотехнологии, ВИР

190000 Россия, Санкт-Петербург, ул. Большая Морская, 42, 44

Anton M. Kamnev, Junior Researcher, Laboratory of Molecular Breeding and DNA passportization, Biotechnology Department, VIR

42, 44, Bolshaya Morskaya Street, St. Petersburg, 190000 Russia

antonkamen@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-9543-7069ЖидехинаТ. В.ZhidekhinaT. V.

Татьяна Владимировна Жидехина, кандидат сельскохозяйственных наук, ведущий научный сотрудник, заведующая отделом ягодных культур, заместитель директора по научной работе, ФНЦ им. И.В. Мичурина

393774 Россия, Тамбовская область, Мичуринск, ул. Мичурина, 30

Tatjana V. Zhidekhina, Cand. Sci. (Agriculture), Leading Researcher, Head, Berry Crops Department, Deputy Director for Science, I.V. Michurin Federal Scientific Center

30, Michurin Street, Tambov Region, Michurinsk, 393774 Russia

berrys-m@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-8334-8069АнтоноваО. Ю.AntonovaO. Yu.

Ольга Юрьевна Антонова, кандидат биологических наук, главный научный сотрудник, лаборатория молекулярной селекции и ДНК-паспортизации, отдел биотехнологии, ВИР

190000 Россия, Санкт-Петербург, ул. Большая Морская, 42, 44

Olga Yu. Antonova, Cand. Sci. (Biology), Chief Researcher, DNA-passportisation and Molecular breeding Laboratory, Biotechnology Department, VIR

42, 44, Bolshaya Morskaya Street, St. Petersburg, 190000 Russia

olgaant326@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-7002-8066ДунаеваС. Е.DunaevaS. E.

Светлана Ефимовна Дунаева, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник, отдел биотехнологии, ВИР

190000 Россия, Санкт-Петербург, ул. Большая Морская, 42, 44

Svetlana E. Dunaeva, Cand. Sci. (Biology), Senior Researcher, Biotechnology Department, N.I. Vavilov All-Russian Institute of Plant Genetic Resources (VIR)

42, 44, Bolshaya Morskaya Street, St. Petersburg, 190000 Russia

dunaevase@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0003-3587-6064ЧухинаИ. Г.ChukhinaI. G.

Ирена Георгиевна Чухина, кандидат биологических наук, главный научный сотрудник отдел агроботаники и in situ сохранения генетических ресурсов растений, ВИР

190000 Россия, Санкт-Петербург, ул. Большая Морская, 42, 44

Irena G. Chukhina, Cand. Sci. (Biology), Chief Researcher, Department of Agrobotany and in situ Conservation of Plant Genetic Resources, VIR

42, 44, Bolshaya Morskaya Street, St. Petersburg, 190000 Russia

irena_wir@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-2605-6569ГавриленкоТ. А.GavrilenkoT. A.

Татьяна Андреевна Гавриленко, доктор биологических наук, главный научный сотрудник, отдел биотехнологии, ВИР

190000 Россия, Санкт-Петербург, ул. Большая Морская, 42, 44

Tatjana A. Gavrilenko, Dr. Sci. (Biology), Chief Researcher, Biotechnology Department, VIR

42, 44, Bolshaya Morskaya Street, St. Petersburg, 190000 Russia

tatjana9972@yandex.ruФедеральный исследовательский центр Всероссийский институт генетических ресурсов растений имени Н.И. ВавиловаРоссияN.I. Vavilov All-Russian Institute of Plant Genetic ResourcesRussian FederationФедеральный научный центр имени И.В. МичуринаРоссияI.V. Michurin Federal Scientific CenterRussian Federation202429092024733141Copyright © Камнев А.М., Жидехина Т.В., Антонова О.Ю., Дунаева С.Е., Чухина И.Г., Гавриленко Т.А., 20242024Камнев А.М., Жидехина Т.В., Антонова О.Ю., Дунаева С.Е., Чухина И.Г., Гавриленко Т.А.Kamnev A.M., Zhidekhina T.V., Antonova O.Y., Dunaeva S.E., Chukhina I.G., Gavrilenko T.A.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://biosel.elpub.ru/jour/article/view/248

В соответствии с правилами Международного кодекса номенклатуры культурных растений оформлены номенклатурные стандарты трех сортов малины обыкновенной (Rubus idaeus L.), созданных в Федеральном научном центре имени И.В. Мичурина (ФНЦ им. И.В. Мичурина). Номенклатурные стандарты сортов ‘Клеопатра’ (WIR-98480), ‘Суламифь’ (WIR-98517) и ‘Шахразада’ (WIR-98536) переданы в Федеральный исследовательский центр Всероссийский институт генетических ресурсов растений имени Н.И. Вавилова (ВИР) на хранение в Гербарии культурных растений мира, их диких родичей и сорных растений (WIR). Согласно комплексной стратегии регистрации и сохранения отечественных сортов вегетативно размножаемых культур в генбанке ВИР, растительный материал, собранный с тех же самых растений автором сортов в ФНЦ им. И.В. Мичурина, был передан не только для создания номенклатурных стандартов, но и для их генотипирования, а также для сохранения в живом виде в коллекции ВИР. С использованием ядерных SSR-маркеров детектирован аллельный состав шести микросателлитных локусов у сортов ‘Клеопатра’, ‘Суламифь’, ‘Шахразада’, для каждого сорта получен индивидуальный микросателлитный профиль. Генотипированные образцы тех же сортов малины, генотипически идентичные номенклатурным стандартам, переданы в полевую коллекцию ВИР, а также сохраняются в контролируемых условиях в коллекции in vitro ВИР.

Nomenclatural standards of three raspberry (Rubus idaeus L.) cultivars ‘Kleopatra’ (WIR-98480), ‘Sulamif’’ (WIR-98517) and ‘Shakhrazada’ (WIR-98536) bred at the I.V. Michurin Federal Scientific Center (FSC) were prepared according to the International Code of Nomenclature for Cultivated Plants. The nomenclatural standards of these cultivars have been transferred to N.I. Vavilov Federal Research Center of the All-Russian Institute of Plant Genetic Resources (VIR) for storage in the Herbarium of Cultivated Plants of the World, Their Wild Relatives and Weeds (WIR). Plant material for herbarium specimens was collected in the experimental field of the I.V. Michurin FSC by the cultivars’ author and handed to VIR for genotyping as well as for preservation in the live collection of VIR in compliance with the comprehensive strategy for registering and preserving domestic cultivars of the vegetatively propagated crops in a genebank. Microsatellite profiles of the three cultivars in question were obtained by using six nuclear SSR-markers. The genotyped specimens of the same raspberry cultivars, genotypically identical to the nomenclatural standards, were transferred to the VIR field collection and preservation in controlled conditions in the VIR in vitro collection.

Rubus idaeus L.сортагербарная коллекциягенотипированиеin vitro коллекцияRubus idaeus L.cultivarsherbarium collectiongenotypingin vitro collectionСтатья подготовлена согласно тематическому плану ВИР по темам: № FGEM-2022-0004, № FGEM-2022-0006 и № FGEM-2022-0008. Авторы благодарят сотрудника ФНЦ им. И.В. Мичурина Гурьеву И.В. за помощь в сборе растительного материала трех сортов из коллекции сортообразцов этого центра и передачи его в ВИР.The article was prepared in accordance with the Thematic Plan of VIR, topics Nos. FGEM-2022-0004, FGEM-2022-0006 and FGEM-2022-0008. The authors thank I.V. Guryeva, an employee of the I.V. Michurin Federal Scientific Center, for her assistance in collecting plant material of three varieties from the collection of variety populations at this Center and transferring it to VIR.ReferencesАнтонова О.Ю., Клименко Н.С., Рыбаков Д.А., Фомина Н.А., Желтова В.В., Новикова Л.Ю., Гавриленко Т.А. SSR-анализ современных российских сортов картофеля с использованием ДНК номенклатурных стандартов. Биотехнология и селекция растений. 2020;3(4):77-96. DOI: 10.30901/2658-6266-2020-4-o2Antonova O.Yu., Klimenko N.S., Rybakov D.A., Fomina N.A., Zheltova V.V., Novikova L.Yu., Gavrilenko T.A. SSR analysis of modern Russian potato varieties using DNA samples of nomenclatural standards. Plant Biotechnology and Breeding. 2020;3(4):77-96. [In Russian]. DOI: 10.30901/2658-6266-2020-4-o2Гербаризация культурных растений: (методические указания) / сост. Н.И. Белозор. Ленинград: ВИР; 1989.Belozor N.I. (comp.) Herbarization of cultivated plants: (guidelines) (Gerbarizatsiya kulturnykh rastenii: (metodicheskie ukazaniya)). Leningrad: VIR; 1989. [in Russian]Brickell C.D., Alexander C., Cubey J.J., David J.C., Hoffman M.H.A., Leslie A.C., Malecot V., Jin X. (eds). International Code of Nomenclature for Cultivated Castillo Plants. Leuven: ISHS Secretariat; 2016.Brickell C.D., Alexander C., Cubey J.J., David J.C., Hoffman M.H.A., Leslie A.C., Malecot V., Jin X. (eds). International Code of Nomenclature for Cultivated Castillo Plants. Leuven: ISHS Secretariat; 2016.Castillo N.R.F., Reed B.M., Graham J., Fernández-Fernández F., Bassil N.V. Microsatellite markers for raspberry and blackberry. Journal of the American Society for Horticultural Science. 2010;135(3):271-278. DOI: 10.21273/JASHS.135.3.271Castillo N.R.F., Reed B.M., Graham J., Fernández-Fernández F., Bassil N.V. Microsatellite markers for raspberry and blackberry. Journal of the American Society for Horticultural Science. 2010;135(3):271-278. DOI: 10.21273/JASHS.135.3.271Дунаева С.Е., Пендинен Г.И., Антонова О.Ю., Швачко Н.А., Ухатова Ю.В., Шувалова Л.Е., Волкова Н.Н., Гавриленко Т.А. Сохранение вегетативно размножаемых культур в in vitro и криоколлекциях: методические указания / под ред. Т.А. Гавриленко. 2-е изд. Санкт-Петербург: ВИР; 2017.Dunaeva S.E., Pendinen G.I., Antonova O.Yu., Shvachko N.A., Ukhatova Y.V., Shuvalova L.E. Volkova N.N., Gavrilenko T.A. Preservation of vegetatively propagated crops in in vitro and cryocollections: methodological guidelines. (Sokhraneniye vegetativno razmnozhayemykh kul’tur v in vitro i kriokollektsiyakh: metodicheskiye ukazaniya). T.A. Gavrilenko (ed.). 2nd ed. St. Petersburg: VIR; 2017. [in Russian]Гашенко Т.А., Фролова Л.В., Божидай Т.Н. Изучение генетического разнообразия образцов малины с использованием SSR-маркеров. Плодоводство. 2023;35:54-61. DOI: 10.47612/0134-9759-2023-35-54-53Gashenko T.A., Frolova L.V., Bozhidai T.N. Study of the genetic diversity of raspberry samples using SSR-markers. Fruit-growing. 2023;35:54-61. [In Russian]. DOI: 10.47612/0134-9759-2023-35-54-53Гавриленко Т.А., Чухина И.Г. Номенклатурные стандарты современных российских сортов картофеля, хранящиеся в гербарии ВИР (WIR): новые подходы к регистрации сортового генофонда в генбанках. Биотехнология и селекция растений. 2020;3(3):6-17. DOI: 10.30901/2658-6266-2020-3-o2Gavrilenko T.A., Chukhina I.G. Nomenclatural standards of modern Russian potato cultivars preserved at the VIR herbarium (WIR): A new approach to cultivar genepool registration in a genebank. Plant Biotechnology and Breeding. 2020;3(3):6-17. [in Russian]. DOI: 10.30901/2658-6266-2020-3-o2Гавриленко Т.А., Дунаева С.Е., Тихонова О.А., Чухина И.Г. Новые подходы к регистрации и сохранению отечественных сортов ягодных культур в генбанке ВИР на примере малины обыкновенной и смородины черной. Биотехнология и селекция растений. 2022;5(4):24-38. DOI: 10.30901/2658-6266-2022-4-o5Gavrilenko T.A., Dunaeva S.E., Tikhonova O.A., Chukhina I.G. New approaches to registration and conservation of domestic cultivars of berry crops in the VIR Genebank on the example of red raspberry and black currant. Plant Biotechnology and Breeding. 2022;5(4):24-38. [In Russian]. DOI: 10.30901/2658-6266-2022-4-o5Girichev V., Hanke M.-V., Peil A., Flachowsky H. SSR fingerprinting of a German Rubus collection and pedigree based evaluation on trueness-to-type. Genetic Resources and Crop Evolution. 2015;64:189-203. DOI: 10.1007/s10722-015-0345-0Girichev V., Hanke M.-V., Peil A., Flachowsky H. SSR fingerprinting of a German Rubus collection and pedigree based evaluation on trueness-to-type. Genetic Resources and Crop Evolution. 2015;64:189-203. DOI: 10.1007/s10722-015-0345-0Международный кодекс номенклатуры культурных растений. Часть III–VI, Приложение I–IX / перевод с английского И.Г. Чухина, С.Р. Мифтахова, В.И. Дорофеев. Пер. изд.: «International Code of Nomenclature for Cultivated Plants. Ed. 9. Scripta Horticulturae. 2016;18:I-XVII+1-190». Vavilovia. 2022;5(1):41-70.International Code of Nomenclature for Cultivated Plants. Division III–VI, Appendix I–IX. I.G. Chukhina, S.R. Miftakhova, V.I. Dorofeуev (transl.).Transl. of: «International Code of Nomenclature for Cultivated Plants. Ed. 9. Scripta Horticulturae. 2016;18:I-XVII+1-190». Vavilovia. 2022;5(1):41-70. [in Russian]Камнев А.М., Дунаева С.Е., Невоструева Е.Ю., Кузьмина А.А., Гавриленко Т.А., Чухина И.Г. Номенклатурные стандарты сортов малины селекции Свердловской селекционной станции садоводства и Новосибирской зональной станции садоводства. Vavilovia. 2022;5(4):13-38. DOI: 10.30901/2658-3860-2022-4-o3Kamnev A.M., Dunaeva S.E., Nevostrueva E.Yu., Kuzmina A.A., Gavrilenko T.A., Chukhina I.G. Nomenclatural standards of raspberry cultivars bred by the Sverdlovsk Horticultural Breeding Station and Novosibirsk Zonal Gardening Station. Vavilovia. 2022;5(4):13-38. [In Russian]. DOI: 10.30901/2658-3860-2022-4-o3Камнев А.М., Яговцева Н.Д., Дунаева С.Е., Гавриленко Т.А., Чухина И.Г. Номенклатурные стандарты сортов малины Алтайской селекции. Vavilovia. 2021;4(2):26-43. DOI: 10.30901/2658-3860-2021-2-26-43Kamnev A.M., Yagovtseva N.D., Dunaeva S.E., Gavrilenko T.A., Chukhina I.G. Nomenclatural standards of raspberry cultivars bred in the Altai. Vavilovia. 2021;4(2):26-43. [In Russian]. DOI: 10.30901/2658-3860-2021-2-26-43Кашичкина М.И. Селекция малины. В кн.: Мичуринское учение на службе народу. Москва: Сельхозгиз; 1955. Вып. 2. С.235-237.Kashichkina M.I. Raspberry breeding (Selektsiya maliny). In: The teachings of Michurin - at the service of the people = Michurinskoe uchenie na sluzhbe narodu. Iss. 2. Moscow: Selkhozgiz; 1955. p.235-237. [In Russian]Казаков И.В. Селекция малины в средней полосе России. Тула; 1989.Kazakov I.V. Raspberry breeding in Central Russia (Selektsiya maliny v sredney polose Rossii). Tula; 1989. [In Russian]Lopes M., Maciel G., Mendonca D., Gil F., Da Camara A. Isolation and characterization of simple sequence repeat loci in R. hochstetterorum and their use in other species from the Rosaceae family. Molecular Ecology Notes. 2006;6:750-752. DOI: 1111/j.1471-8286.2006.01329.xLopes M., Maciel G., Mendonca D., Gil F., Da Camara A. Isolation and characterization of simple sequence repeat loci in R. hochstetterorum and their use in other species from the Rosaceae family. Molecular Ecology Notes. 2006;6:750-752. DOI: 1111/j.1471-8286.2006.01329.xПомология. Т. 5. Земляника, малина, орехоплодные и редкие культуры / ред. Е.Н. Седов. Орел: ВНИИСПК; 2014.Sedov E.N. (ed.) Pomology. Vol. 5. Strawberry, raspberry, nut and rare crops. Orel: VNIISPB; 2014. [In Russian]Untergasser A., Nijveen H., Rao X., Bisseling T., Geurts R., Leunissen J.A.M. Primer3Plus, an enhanced web interface to Primer3. Nucleic Acids Research. 2007;35(Iss. suppl. 2):71-74. DOI: 10.1093/nar/gkm306Untergasser A., Nijveen H., Rao X., Bisseling T., Geurts R., Leunissen J.A.M. Primer3Plus, an enhanced web interface to Primer3. Nucleic Acids Research. 2007;35(Iss. suppl. 2):71-74. DOI: 10.1093/nar/gkm306Woodhead M., Smith K., McCallum S., Cardle L., Mazzitelli M., Graham J. Identification, characterization and mapping of simple sequence repeat (SSR) markers from raspberry root and bud ESTs. Molecular Breeding 2008;22(4):555-563. DOI: 10.1007/s11032-008-9198-yWoodhead M., Smith K., McCallum S., Cardle L., Mazzitelli M., Graham J. Identification, characterization and mapping of simple sequence repeat (SSR) markers from raspberry root and bud ESTs. Molecular Breeding 2008;22(4):555-563. DOI: 10.1007/s11032-008-9198-yЖидехина Т.В. Динамика изменения сортового состава малины в связи с успехами селекции. В кн.: И.В. Мичурин и агротехнологические аспекты производства плодов и овощей на современном этапе: материалы международной научно-практической конференции; 28-30 сентября 2005 г.; Воронеж, Россия / под ред. Н.М. Круглова. Воронеж: ВГАУ; 2005. С.103-108.Zhidekhina T.V. Dynamics of change in raspberry cultivar assortment due to success in breeding (Dinamika izmeneniya sortovogo sostava maliny v svyazi c uspekhami selektsii). In: N.M. Kruglov (ed.). I.V. Michurin and agrotechnological aspects of fruits and vegetables production: proceedings of international scientific and practical conference (I.V. Michurin i agrotekhnologicheskie aspekty proizvodstva plodov i ovoshchey na sovremennom etape: materialy mezhdunarodnoy nauchno-prakticheskoy konferentsii); 2005 September 28-30, Voronezh, Russia. Voronezh: VSAU; 2005. p.103-108. [In Russian]Жидехина Т.В. Формирование научной школы по селекции ягодных культур во ВНИИС им. И.В. Мичурина. В кн.: Инновационные основы развития садоводства России / отв. ред. Ю.В. Трунов. Воронеж: Кварта, 2011а. С.41-48.Zhidekhina T.V. Formation of the scientific school for berry crop breeding in the I.V. Michurin ARIH (Formirovaniye nauchnoy shkoly po selektsii yagodnykh kul’tur vo VNIIS im. I.V. Michurina). In: Yu.V. Trunov (ed.) Innovative fundamentals of Russian horticulture development (Innovatsionnye osnovy razvitiya sadovodstva Rossii). Voronezh: Kvarta; 2011a. p.41-48. [In Russian]Жидехина Т.В. Совершенствование сортимента малины в условиях Тамбовской области. В кн.: Достижения, перспективы и направления развития садоводства и питомниководства в Российской Федерации: материалы научно-практической конференции; 3-4 сентября 2011 г.; Мичуринск, Россия. Мичуринск-наукоград РФ; 2011b. С.131-138.Zhidekhina T.V. Improvement of raspberry cultivar assortment in the conditions of Tambov Region (Sovershenstvovaniye sortimenta maliny v usloviyakh Tambovskoy oblasti). In: Achievements, prospects and directions of horticulture and nursery development in the Russian Federation: Proceedings of scientific and practical conference (Dostizheniya, perspektivy i napravleniya razvitiya sadovodstva i pitomnikovodstva v Rossiyskoy Federatsii: Materialy mezhdunarodnoy nauchno-prakticheskoy konferentsii); 2011 September 3-4; Michurinsk, Russia. Michurinsk, Russia; 2011b. p.131-138. [In Russian]

The authors declare that there are no conflicts of interest present.